El justificante de firma, también conocido como stamper, sello o CSV (código seguro de verificación), nO modifica el contenido del PDF porque lo hacemos acorde al estándar de firma de PDF.
Este estándar determina cómo y dónde se pueden/deben usar estas «representaciones gráficas» (anotaciones según el diccionario de datos del PDF), y más en concreto, anotaciones asociadas a una firma electrónica.
Por tanto, y a modo de resumen, NO modifica el contenido. Se trata de una anotación agregada en una capa habilitada para tal propósito en el diccionario de datos del estándar PDF.